初夏の三千院は、苔と楓の若葉が目にまぶしいほど青々として、爽やかな風情を楽しむことができます。
奥の院の側にある「あじさい苑」では3000株の紫陽花が咲き誇ります。 6月中旬の見頃開始時に楽しめるのは、ほのかに香る小紫陽花や、昔は「幻のあじさい」と呼ばれていた星紫陽花（七段花）。 その後、7月の上旬まで見頃が続く山紫陽花や額紫陽花が、繊細な色のグラデーションを見せてくれます。
あじさい祭の初日には法要行事があり、期間中は毎日チャリティー墨蹟展が開かれています。
